Литература

1. Tillotson G.S., Zinner S.H. Burden of antimicrobial resistance in an era of decreasing susceptibility. Expert Rev Anti Infect Ther. 2017;15(7):663–676.

https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/14787210.2017.1337508?journalCode=ierz20


2. Козлов Р.С., Голуб А.В. Остановить темпы роста антибиотикорезистентности микроорганизмов сегодня – дать шанс на выживание человечества завтра. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(4):310–315.

https://cmac-journal.ru/publication/2019/4/cmac-2019-t21-n4-p310/


3. Всемирная организация здравоохранения. Глобальный план действий по борьбе с устойчивостью к противомикробным препаратам. Geneva, Switzerland; 2016.

https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/254884/9789244509760-rus.pdf?sequence=1


4. Распоряжение правительства Российской Федерации от 25 Сентября 2017 г. № 2045-р «Стратегия предупреждения распространения антимикробной резистентности в Российской Федерации на период до 2030 года».

http://static.government.ru/media/files/onJ3GY3ObDGqLDvrED7AhpLF3ywRRFpp.pdf


5. Michael C.A., Dominey-Howes D., Labbate M. The antimicrobial resistance crisis: causes, consequences, and management. Front public Heal. 2014;2:145.

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpubh.2014.00145/full


6. Tacconelli E., Sifakis F., Harbarth S., Schrijver R., van Mourik M., Voss A., et al. Surveillance for control of antimicrobial resistance. Lancet Infect Dis. 2018;18(3):e99–106.

https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(17)30485-1/fulltext


7. Stratchounski L.S., Dekhnich A.V., Kretchikov V.A., Edelstain I.A., Narezkina A.D., Afinogenov G.E., et al. Antimicrobial resistance of nosocomial strains of Staphylococcus aureus in Russia: results of a prospective study. J Chemother. 2005;17(1):54–60.

https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1179/joc.2005.17.1.54


8. Stratchounski L.S., Kozlov R.S., Appelbaum P.C., Kretchikova O.I., KosowskaShick K. Antimicrobial resistance of nasopharyngeal pneumococci from children from day-care centres and orphanages in Russia: results of a unique prospective multicentre study. Clin Microbiol Infect. 2006;12(9):853–866.

https://www.clinicalmicrobiologyandinfection.com/article/S1198-743X(14)64303-2/fulltext


9. Stratchounski L.S., Kretchikova O.I., Kozlov R.S., Reshedko G.K., Stetsiouk O.U., Tarasova G.D., et al. Antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae isolated from healthy children in day-care centers: results of a multicenter study in Russia. Pediatr Infect Dis J. 2000;19(3):196–200.

https://journals.lww.com/pidj/Abstract/2000/03000/Antimicrobial_resistance_ofStreptococcus.4.aspx


10. Кузьменков А.Ю., Трушин И.В., Авраменко А.А., Эйдельштейн М.В., Дехнич А.В., Козлов Р.С. AMRmap: Интернет-платформа мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(2):84–90.

https://cmac-journal.ru/publication/2017/2/cmac-2017-t19-n2-p084/


11. Виноградова А.Г., Кузьменков А.Ю. Организация данных как основа локального мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020;22(2):137–141.

https://cmac-journal.ru/publication/2020/2/cmac-2020-t22-n2-p137/


12. Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г., Трушин И.В., Авраменко А.А., Эйдельштейн М.В., Дехнич А.В., и соавт. AMRcloud: новая парадигма мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):119–124.

https://cmac-journal.ru/publication/2019/2/cmac-2019-t21-n2-p119/


13. Lushniak B.D. Antibiotic resistance: a public health crisis. Public Health Rep. 2014;129(4):314–316.

https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/003335491412900402


14. Ferri M., Ranucci E., Romagnoli P., Giaccone V. Antimicrobial resistance: a global emerging threat to public health systems. Crit Rev Food Sci Nutr. 2017;57(13):2857–2876.

https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/10408398.2015.1077192?journalCode=bfsn20


15. Núñez-Núñez M., Navarro M.D., Palomo V., Rajendran N.B., del Toro M.D., Voss A., et al. The methodology of surveillance for antimicrobial resistance and healthcare-associated infections in Europe (SUSPIRE): a systematic review of publicly available information. Clinical Microbiology and Infection. 2018;24(2):105–109.

https://www.clinicalmicrobiologyandinfection.com/article/S1198-743X(17)30385-3/fulltext


16. Masterton R. The Importance and Future of Antimicrobial Surveillance Studies. Clin Infect Dis. 2008;47(S1):S21–31.

https://academic.oup.com/cid/article/47/Supplement_1/S21/304789


17. Coulehan M.B., Wells J.F. Guidelines for responsible data management in scientific research. 46 p.

https://ori.hhs.gov/guidelines-responsible-datamanagementscientific-research


18. Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г. Мониторинг антибиотикорезистентности: обзор информационных ресурсов. Бюллетень сибирской медицины. 2020;19(2):163–170.

https://bulletin.tomsk.ru/jour/article/view/2873/1753


19. Perez F., Villegas M.V. The role of surveillance systems in confronting the global crisis of antibiotic-resistant bacteria. Curr Opin Infect Dis. 2015;28(4): 375–383.

https://journals.lww.com/co-infectiousdiseases/Abstract/2015/08000/The_role_of_surveillance_systems_in_confronting.14.aspx


20. Яковлев С.В., Брико Н.И., Сидоренко С.В., Проценко Д.Н. Программа СКАТ (Стратегия Контроля Антимикробной Терапии) при оказании стационарной медицинской помощи. 2018; 156 с. Доступно по адресу: http://nasci. ru/?id=2880

http://nasci.ru/?id=2880


21. CDDEP. ResistanceMap: Antibiotic Resistance. 2020.

https://resistancemap.cddep.org/AntibioticResistance.php


22. CDC. Surveillance Reports.

http://www.cdc.gov/abcs/reports-findings/surv-reports.html


23. The British Society for Antimicrobial Chemotherapy. Resistance Surveillance Project.

http://www.bsacsurv.org/


24. Edwards J.R., Peterson K.D., Mu Y., Banerjee S., Allen-Bridson K., Morrell G., et al. National Healthcare Safety Network (NHSN) report: Data summary for 2006 through 2008, issued December 2009. Am J Infect Control. 2009;37(10):783–805.

https://www.ajicjournal.org/article/S0196-6553(09)00839-6/fulltext


25. Antimicrobial Resistance Standing Committee. National Surveillance and Reporting of Antimicrobial Resistance and Antibiotic Usage for Human Health in Australia (Project AMRAU). 2013; 152 p.

https://www.safetyandquality.gov.au/sites/default/files/migrated/National-surveillance-and-reporting-of-antimicrobial-resistance-andantibioticusage-for-human-health-in-Australia.pdf


26. Fuhrmeister A.S., Jones R.N. The Importance of antimicrobial resistance monitoring worldwide and the origins of SENTRY antimicrobial surveillance program. Open Forum Infect Dis. 2019;6(Suppl.1):S1–4.

https://academic.oup.com/ofid/article/6/Supplement_1/S1/5381628


27. European Centre for Disease Prevention and Control. Surveillance of antimicrobial resistance in Europe 2018.

https://www.ecdc.europa.eu/en


28. Виноградова А.Г., Кузьменков А.Ю. Практическое применение AMRmap: элементы подхода «от общего к частному» на примере Klebsiella pneumoniae. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):181–186.

https://cmac-journal.ru/publication/2019/2/cmac-2019-t21-n2-p181/


29. ГОСТ Р 53079.2-2008 Технологии лабораторные клинические. Обеспечение качества клинических лабораторных исследований. Часть 2. Руководство по управлению качеством в клинико-диагностической лаборатории. Типовая модель. 2010.

http://docs.cntd.ru/document/1200073591


30. МУ 4.2.2039-05 Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории. 2006; 23 с.

http://docs.cntd.ru/document/1200044664


31. Культуры крови (гемокультуры). Ключевое исследование для диагностики инфекций кровотока.

https://www.biomerieux-russia.com/sites/subsidiary_ru/files/biomerieux_-_blood_culture_-_ru_-_final.pdf


32. Решедько Г.К. Определение чувствительности к антибиотикам: методы, результаты, оценка.

http://www.antibiotic.ru/rus/all/articles/absens.shtml


33. Тапальский Д.В., Бильский И.А. Определение чувствительности к антибиотикам методом микроразведений в бульоне: модификация, доступная для всех. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2018;20(1):62–67.

https://cmac-journal.ru/publication/2018/1/cmac-2018-t20-n1-p062/


34. Шамина О.В., Крыжановская О.А., Лазарева А.В., Поликарпова С.В., Карасева О.В., Чеботарь И.В. и соавт. Сравнение методов определения устойчивости к колистину у карбапенемрезистентных штаммов Klebsiella pneumoniae. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(10):646–650.

http://www.medlit.ru/journalsview/lab/view/journal/2018/issue-10/1663-sravnenie-metodov-opredeleniya-ustoychivosti-k-kolistinu-u-karbapenemrezistentnyh-shtammov-klebsiella-pneumoniae/


35. ISO 20776-1:2019. Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices – Part 1: Broth micro-dilution reference method for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing aerobic bacteria involved in infectious diseases. 2019.

https://www.iso.org/standard/70464.html


36. Приказ Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии Российской Федерации от 23 ноября 2010 г. N 499-ст.

http://docs.cntd.ru/document/902264310


37. Jorgensen J.H., Ferraro M.J. Antimicrobial Susceptibility Testing: A review of general principles and contemporary practices. Clin Infect Dis. 2009;49(11):1749– 1755.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19857164


38. Kahlmeter G., Giske C.G., Kirn T.J., Sharp S.E. Point-Counterpoint: differences between the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing and Clinical and Laboratory Standards Institute Recommendations for reporting antimicrobial susceptibility results. J Clin Microbiol. 2019;57(9): e01129-19.

https://jcm.asm.org/content/57/9/e01129-19


39. Pantozzi F.L., Ibar M.P., Nievas V.F., Vigo G.B., Moredo F.A., Giacoboni G.I. Wild-type minimal inhibitory concentration distributions in bacteria of animal origin in Argentina. Rev Argent Microbiol. 2014;46(1):34–40.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0325754114700458?via%3Dihub


40. Kronvall G., Giske C.G., Kahlmeter G. Setting interpretive breakpoints for antimicrobial susceptibility testing using disk diffusion. Int J Antimicrob Agents. 2011;38(4):281–290.

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0924857911001968?via%3Dihub


41. Всемирная организация здравоохранения. Эпиднадзор за устойчивостью к противомикробным препаратам в Центральной Азии и Восточной Европе. Ежегодный доклад. Женева; 2019; 167 с.

http://www.euro.who.int/PubRequest?language=Russian


42. Сухорукова М.В. Определение чувствительности микроорганизмов к антибиотикам: что стоит за результатом. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2013;15(3):219–229.

https://cmac-journal.ru/publication/2013/3/cmac-2013-t15-n3-p219/


43. Кафтырева Л.А., Зуева Л.П., Колосовская Е.Н., Егорова С.А., Макарова М.А., Светличная Ю.С., Кузин А.А., Свистунов С.А. Принципы организации мониторирования устойчивости ведущих возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, к антимикробным препаратам к антимикробным препаратам в лечебно-профилактических медицинских организациях здравоохранения. 2014; 137 с.

http://nasci.ru/?id=3374


44. EUCAST. Экспертные правила определения чувствительности к антибиотикам EUCAST.

https://www.eucast.org/expert_rules_ and_intrinsic_resistance/


45. Полонская А.В., Корниенко М.А., Манолов А.И., Купцов Н.С., Смирнов Г.Б., Любасовская Л.А., Припутневич Т.В., Шитиков Е.А., Ильина Е.Н. Вариабельность генов рекомбиназ и mecA стафилококковой хромосомной кассеты Staphylococcus haemolyticus. Антибиотики и Химиотерапия. 2018;63(7–8):33–40.

https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/94/94


46. Тимофеева О.Г., Поликарпова С.В. Локальный микробиологический мониторинг штаммов Enterobacterales, продуцирующих карбапенемазы. Лабораторная служба. 2019;8(3):14.

https://www.mediasphera.ru/issues/laboratornaya-sluzhba/2019/3/1230521982019031014


47. Kumari R., Banerjee T., Anupurba S. Molecular detection of drug resistance to ofloxacin and kanamycin in Mycobacterium tuberculosis by using multiplex allelespecific PCR. J Infect Public Health. 2018;11(1):54–58.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1876034117300990?via%3Dihub


48. Malik T., Naim A., Saeed A. Molecular Detection of TEM, SHV and CTX-M Genes among Gram-negative Klebsiella Isolates. Curr Drug Deliv. 2018;15(3):417– 423.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29295691/


49. Thirumalmuthu K., Devarajan B., Prajna L., Mohankumar V. Mechanisms of fluoroquinolone and aminoglycoside resistance in keratitis-associated Pseudomonas aeruginosa. Microb Drug Resist. 2019;25(6):813–823.

https://www.liebertpub.com/doi/10.1089/mdr.2018.0218


50. Shaaban M., Al-Qahtani A., Al-Ahdal M., Barwa R. Molecular characterization of resistance mechanisms in Pseudomonas aeruginosa isolates resistant to carbapenems. J Infect Dev Ctries. 2018;11(12):935–943.

https://jidc.org/index.php/journal/article/view/9501


51. EUCAST guidelines for detection of resistance mechanisms and specific resistances of clinical and/or epidemiological importance. 2017.

https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Resistance_ mechanisms/EUCAST_detection_of_resistance_mechanisms_170711.pdf


52. Global Antimicrobial Resistance Surveillance System. Molecular methods for antimicrobial resistance (AMR) diagnostics to enhance the Global Antimicrobial Resistance Surveillance System. 2019.

https://www.who.int/glass/resources/publications/molecular-methods-for-amr-diagnostics/en/


53. Global Antimicrobial Resistance Surveillance System. GLASS whole-genome sequencing for surveillance of antimicrobial resistance. 2020.

https://www.who.int/publications/i/item/9789240011007


54. Шайдуллина Э.Р., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Сухорукова М.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных карбапенемазопродуцирующих штаммов Enterobacterales в России: результаты эпидемиологического исследования 2014–2016 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2018;20(4):362–369.

https://cmac-journal.ru/publication/2018/4/cmac-2018-t20-n4-p362/


55. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Иванчик Н.В., Склеенова Е.Ю., Шайдуллина Э.Р., Шек Е.А., и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacterales в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН 2015–2016. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):147–159.

https://cmac-journal.ru/publication/2019/2/cmac-2019-t21-n2-p147/


56. Попов Д.А. Сравнительная характеристика современных методов определения продукции карбапенемаз. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):125–33.

https://cmac-journal.ru/publication/2019/2/cmac-2019-t21-n2-p125/


57. Белобородов В.Б., Гусаров В.Г., Дехнич А.В., Замятин М.Н., Зубарева Н.А., Зырянов С.К. и соавт. Диагностика и антимикробная терапия инфекций, вызванных полирезистентными микроорганизмами. Вестник анестезиологии и реаниматологии. 2020;16(1):52–83.

http://www.antibiotic.ru/files/pdf/2019/guidelines-daticmm-20191204.pdf


58. Эйдельштейн М.В., Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Микотина А.В., Шек Е.А. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):37–41.

https://cmac-journal.ru/publication/2017/1/cmac-2017-t19-n1-p037/


59. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Шек Е.А., Дехнич А.В. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):42–48.

https://cmac-journal.ru/publication/2017/1/cmac-2017-t19-n1-p042/


60. Becker K., Denis O., Roisin S., Mellmann A., Idelevich E.A., Knaack D., et al. Detection of mecA – and mecC -Positive Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Isolates by the New Xpert MRSA Gen 3 PCR Assay. J Clin Microbiol. 2016;54(1):180–184.

https://jcm.asm.org/content/54/1/180


61. Tenover F.C., Tickler I.A., Le V.M., Dewell S., Mendes R.E., Goering R.V. Updating molecular diagnostics for detecting methicillin-susceptible and methicillinresistant Staphylococcus aureus isolates in blood culture bottles. J Clin Microbiol. 2019;57(11): e01195-19.

https://jcm.asm.org/content/57/11/e01195-19


62. AMRFinderPlus.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/antimicrobial-resistance/AMRFinder/


63. ResFinder.

https://cge.cbs.dtu.dk/services/ResFinder/


64. Fontaine R.E. Describing epidemiologic data. The CDC Field Epidemiology Manual. Oxford University Press; 2018. 528 p.

https://www. cdc.gov/eis/field-epi-manual/chapters/Describing-Epi-Data.html


65. Arts DGT. Defining and improving data quality in medical registries: a literature review, case study, and generic framework. J Am Med Informatics Assoc. 2002;9(6):600–611.

https://academic.oup.com/jamia/articlelookup/doi/10.1197/jamia.M1087


66. НСИ. Федеральный справочник лабораторных исследований. Справочник лабораторных материалов и образцов. 2019.

https://nsi.rosminzdrav.ru/#!/refbook/1.2.643.5.1.13.13.11.1081/version/2.2


67. НСИ. Справочник территории (СМРПМЗ). 2016.

https://nsi.rosminzdrav.ru/#!/refbook/1.2.643.5.1.13.2.1.1.346/version/1.0


68. Stelling J. Руководство по WHONET. Глобальная система эпиднадзора за устойчивостью к противомикробным препаратам. 2016. 39 с.

http://www.whonet.org/Docs/WHONET_for_GLASS. Russian.docx


69. Всемирная организация здравоохранения. WHONET 5. Программное обеспечение базы данных микробиологической лаборатории. 128 с.

https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/ 10665/91616/WHO_CDS_CSR_DRS_99.1_rus.pdf?sequence= 1&isAllowed=y


70. WHONET. Официальная документация.

https://whonet.org/documentation.html


71. WHONET for CAESAR. Manual. 2020; 71 p.

https://whonet.org/docserv/Manual_WHONET_for_CAESAR.pdf


72. WHO. Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial resistance. BacLink.Excel, text files, and other desktop applications. 2006; 35 p.

https://whonet.org/Docs/BacLink 2.Excel, text files, other applications.doc


73. Pan American Health Organization. Epidemiological Surveillance of Healthcare-Associated Infections. 2011.

https://www.paho.org/hq/dmdocuments/2011/ENG_ Modulo_I_final.pdf


74. CDC. Procedure-associated Module. Surgical Site Infection (SSI) Event. 2020.

https://www.cdc.gov/nhsn/pdfs/pscmanual/9pscssicurrent.pdf


75. Infectious Diseases Society of America. Clinical practice guideline for the management of asymptomatic bacteriuria: 2019 update by the infectious diseases society of America. 2019.

https://www.idsociety.org/practiceguideline/asymptomatic-bacteriuria/



Изменено 19 февраля 2021