3.4 Основные процедуры в микробиологической лаборатории

В рамках микробиологического исследования проводят следующие процедуры:

1. Прием и оценка качества и репрезентативности биоматериала для микробиологического исследования в лаборатории.

При поступлении образцов биоматериала в лабораторию необходимо:

  1. Оценить полноту заполнения направления (сопроводительной информации) для МИ.
  2. Оценить качество образца (маркировка, целостность контейнера, соблюдение условий взятия и транспортировки (надлежащий контейнер/транспортная среда, сроки доставки и т.д.).
  3. Оценить соответствие вида клинического материала предполагаемой инфекционной патологии: локализация и возможность выделения вероятных возбудителей.

2. Посев на искусственные питательные среды, выделение чистой культуры и идентификация возбудителя

Питательные среды для первичного посева клинического материала и условия инкубации должны обеспечивать возможность выделения максимально широкого круга потенциальных возбудителей.

Выбор сред и условий инкубации определяется видом клинического материала, диагнозом инфекционной патологии и предполагаемыми возбудителями, задачами МИ, а также наличием дополнительных факторов риска присутствия нетипичных и/или резистентных возбудителей, и проводится в соответствии со стандартными процедурами лаборатории.

3. Оценка клинического значения выделенных микроорганизмов

Проводится на основании результатов МИ с учетом клинико-демографических, эпидемиологических данных:

  • видов выделенных микроорганизмов, их количественного соотношения при наличии ассоциаций;
  • количества выделенных видов микроорганизмов;
  • соответствие видов выделенных микроорганизмов локализации инфекции;
  • соответствие видов выделенных микроорганизмов и результатов микроскопического исследования (обязательно: при исследовании крови, материала нижних дыхательных путей; рекомендуется при исследовании других видов материала по возможности);
  • факторов риска развития инфекции и/или наличия резистентных возбудителей.

4. Определение чувствительности к антибиотикам и выявление механизмов резистентности клинически значимых возбудителей

Для мониторинга АР необходимо использовать результаты определения чувствительности возбудителей, выделенных в чистой культуре. Данные, полученные с помощью прямого определения чувствительности возбудителей в гемокультуре, не рекомендуется включать в мониторинг АР.

Молекулярно-генетические методы идентификации и выявления детерминант устойчивости возбудителей к АМП могут быть использованы как напрямую в клиническом материале, так и в выделенной чистой культуре возбудителя. Результаты выявления механизмов устойчивости к АМП молекулярно-генетическими методами также могут учитываться в процессе мониторинга, но они не заменяют в полном объеме и не исключают необходимости выполнения стандартных фенотипических методов определения чувствительности к АМП.

5. Формирование ответа (отчета) о результатах микробиологического исследования

В отчет о результатах индивидуального МИ следует включать информацию:

  • результат микроскопического исследования (если проводилось);
  • вид и количество (при количественном или полуколичественном исследовании) выделенных возбудителей, имеющих клиническое значение;
  • результаты определения чувствительности к антибиотикам возбудителей, имеющих клиническое значение:
    • клиническая категория чувствительности (Ч/S, У/I, Р/R, если установлены);
    • значение МПК, мг/л (если определено);
    • сравнение значения МПК с эпидемиологическими точками отсечения (где применимо при отсутствии клинических категорий чувствительности, см. раздел 3.5.);
  • результаты выявления механизмов резистентности;
  • дополнительные комментарии при необходимости.

6. Организация, хранение данных

В рамках лаборатории могут использованы различные варианты работы с данными. Подробная информация представлена в разделе 4.1. Сценарии потоков данных.


Изменено 27 сентября 2021