3.4 Основные процедуры в микробиологической лаборатории
В рамках микробиологического исследования проводят следующие процедуры:
1. Прием и оценка качества и репрезентативности биоматериала для микробиологического исследования в лаборатории.
При поступлении образцов биоматериала в лабораторию необходимо:
- Оценить полноту заполнения направления (сопроводительной информации) для МИ.
- Оценить качество образца (маркировка, целостность контейнера, соблюдение условий взятия и транспортировки (надлежащий контейнер/транспортная среда, сроки доставки и т.д.).
- Оценить соответствие вида клинического материала предполагаемой инфекционной патологии: локализация и возможность выделения вероятных возбудителей.
Внимание!
При выявлении несоответствий необходимо провести бракераж образцов, регистрацию выявленных несоответствий, а также информировать лечащего врача (или другое лицо, ответственное за взятие материла) и обсудить возможные дальнейшие действия. Основные процедуры описаны в ГОСТ ИСО 15189 «Лаборатории медицинские. Частные требования к качеству и компетентности».2. Посев на искусственные питательные среды, выделение чистой культуры и идентификация возбудителя
Питательные среды для первичного посева клинического материала и условия инкубации должны обеспечивать возможность выделения максимально широкого круга потенциальных возбудителей.
Выбор сред и условий инкубации определяется видом клинического материала, диагнозом инфекционной патологии и предполагаемыми возбудителями, задачами МИ, а также наличием дополнительных факторов риска присутствия нетипичных и/или резистентных возбудителей, и проводится в соответствии со стандартными процедурами лаборатории.
Внимание!
Выделение возбудителя в чистой культуре необходимо для выполнения фенотипического определения чувствительности к АМП и является обязательным условием осуществления мониторинга АР.3. Оценка клинического значения выделенных микроорганизмов
Проводится на основании результатов МИ с учетом клинико-демографических, эпидемиологических данных:
- видов выделенных микроорганизмов, их количественного соотношения при наличии ассоциаций;
- количества выделенных видов микроорганизмов;
- соответствие видов выделенных микроорганизмов локализации инфекции;
- соответствие видов выделенных микроорганизмов и результатов микроскопического исследования (обязательно: при исследовании крови, материала нижних дыхательных путей; рекомендуется при исследовании других видов материала по возможности);
- факторов риска развития инфекции и/или наличия резистентных возбудителей.
4. Определение чувствительности к антибиотикам и выявление механизмов резистентности клинически значимых возбудителей
Для мониторинга АР необходимо использовать результаты определения чувствительности возбудителей, выделенных в чистой культуре. Данные, полученные с помощью прямого определения чувствительности возбудителей в гемокультуре, не рекомендуется включать в мониторинг АР.
Молекулярно-генетические методы идентификации и выявления детерминант устойчивости возбудителей к АМП могут быть использованы как напрямую в клиническом материале, так и в выделенной чистой культуре возбудителя. Результаты выявления механизмов устойчивости к АМП молекулярно-генетическими методами также могут учитываться в процессе мониторинга, но они не заменяют в полном объеме и не исключают необходимости выполнения стандартных фенотипических методов определения чувствительности к АМП.
5. Формирование ответа (отчета) о результатах микробиологического исследования
В отчет о результатах индивидуального МИ следует включать информацию:
- результат микроскопического исследования (если проводилось);
- вид и количество (при количественном или полуколичественном исследовании) выделенных возбудителей, имеющих клиническое значение;
- результаты определения чувствительности к антибиотикам возбудителей, имеющих клиническое значение:
- клиническая категория чувствительности (Ч/S, У/I, Р/R, если установлены);
- значение МПК, мг/л (если определено);
- сравнение значения МПК с эпидемиологическими точками отсечения (где применимо при отсутствии клинических категорий чувствительности, см. раздел 3.5.);
- результаты выявления механизмов резистентности;
- дополнительные комментарии при необходимости.
Внимание!
Значение диаметров зон подавления роста, мм, не рекомендуется включать в отчет о результатах микробиологического исследования для лечащего врача. Но, как значения МПК, так и значения диаметров зон подавления роста, необходимо регистрировать в первичной документации лаборатории (протоколах исследования) на бумажных и/или электронных носителях.6. Организация, хранение данных
В рамках лаборатории могут использованы различные варианты работы с данными. Подробная информация представлена в разделе 4.1. Сценарии потоков данных.
Изменено 15 января 2024